Primeres referències
Les primeres referències que tenim sobre l'existència d'un arxiu daten del 1707, tot i que la voluntat de conservar els documents importants és molt més antiga, només cal pensar en els pergamins del segle XII. Però, l'arxiu de 1707, ubicat a l'església parroquial de Sant Martí, no era cap meravella i es feia difícil trobar-hi res. Per aquest motiu, els jurats del Castell de Palafrugell van nomenar com a secretari a Salvador Vergonyós, amb la tasca de posar ordre a tot aquell desgavell en un termini de sis anys.
Amb les invasions franceses, durant la Guerra Gran i la Guerra de la Independència, es van haver d'amagar els documents que tenien a veure amb el Govern Espanyol. I, com sempre passa quan hi ha remenament, alguns es van perdre.
El maig de 1845, el ple de l'Ajuntament acorda posar un armari a la Casa Consistorial, al carrer dels Valls, per desar-hi els documents més recents i, així, evitar-se les anades i vingudes a l'església. D'aquest nou arxiu, en sabem poques coses més. Només que el 1930, es van llençar alguns papers que es van considerar de poca importància.